收费：进出岛实行年费制
在翔安隧道翔安端的西滨立交桥附近，设置了一个收费站，而五通端没有收费站。翔安隧道通行的收费标准与厦门大桥、海沧大桥等一样，实行年费制。 从4月27日零时起，隧道收费站启用。
公交：4条线路经过隧道
我市开通了4条经过翔安隧道的公交线路。这4条线路，有连通翔安与岛内的，还有经岛内往海沧等地的。它们分别是直达班线750路，从马巷车站至火车站；大站快线751路，从厦大翔安校区至厦大；752路，从翔安公交车站至会展中心；大站快线780路，从翔安新店至海沧车站。
禁行：一些车辆不能通行
翔安隧道开通后，禁止行人、非机动车 （包括自行车、电动自行车、三轮车、人力车、畜力车、残疾人机动轮椅车等）、摩托车、拖拉机、低速载货汽车、三轮汽车、轮式专用机械车、履带式车辆、教练车、悬挂试车号牌的车辆通行。
求援：设置多种求援方式
翔安隧道每隔200米在行车右侧设置一部紧急电话，发生紧急事件时可拨打该电话求援。该电话为免提式，只要按下绿色通话按钮即可与监控中心通话。翔安隧道内移动信号完全覆盖（移动、电信、联通），在发生紧急事件时（交通事故、火灾等）也可通过手机拨打120、110、119等电话。发生火灾时可直接按隧道右侧壁每50米一个的火灾报警按钮报警。报警时用手击碎玻璃报警，该玻璃经过特殊处理，不会划伤手。
消防：消火栓每50米一个
翔安隧道行车左侧每隔25米设自动喷淋设施。行车右侧每隔50米设消火栓及灭火器，遇火灾事件，司乘人员可从就近的消火栓箱内取出灭火器及用消火栓喷水灭火。
翔安隧道共有3条通道，中间的服务隧道功能很大。一般车辆不能在内行驶，一旦发生险情，应急救援车辆可进入。
如果在隧道里发生交通事故或者遇到其他险情，记着一定要从最近的人行横道逃出。在翔安隧道内，总共设有12处人行横道和5处车行横道，横道间距约为300米。
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